Excelente resuelto el problema! Dejo por aquí la solución para futuras personas que quizás tengan lo mismo.

PARA QUIEN NO LE APAREZCA LA CARPETA VAR:

Solo hay que crear las estructuras de carpetas es decir: var/cpanel/reseller/includes ,
y ahí dentro colocar el archivo, todo igual como dice la guía cuando te bajas el comprimido en las descargas.