Hola Pablo, claro que es posible. De entrada de invitare a revisar los Data Feed de WHMCS en este enlace: https://docs.whmcs.com/Data_Feeds

Ahora, existen dos Feeds extra que no aparecen en el articulo anterior, estos son cartnumitems.php y carttotal.php, con estos dos feeds puedes realizar lo que deseas.

Un ejemplo super básico de como lo utilizarías es con algun código como este de aca, el cual mostrará la cantidad de items en tu carrito:

<script language="javascript" src="feeds/cartnumitems.php"></script>

Seguramente tendrás que modificar la ruta del feed, ademas de personalizarlo con CSS. Pero con eso logras poner el numero de items de carrito fuera de WHMCS.

NOTA: El feed carttotal.php si recuerdo bien, te muestra el valor total del carrito, quizás te sirve también.